W skład Urzędu wchodzą następujące wydziały i inne wewnętrzne komórki organizacyjne, równorzędne wydziałom:

1) Gabinet Marszałka (GM),
2) Biuro Obsługi Zarządu (BOZ),
3) Wydział Polityki Regionalnej (WPR),
4) Wydział Zdrowia (WZ),
5) Wydział Współpracy Społecznej (WWS),
6) Wydział Infrastruktury i Transportu (WIiT),
7) Wydział Rolnictwa i Ochrony Środowiska (WRiOŚ),
8) Wydział Kultury, Edukacji i Sportu (WKEiS),
9) Wydział Turystyki, Gospodarki i Promocji (WTGiP),
10) Wydział Finansów i Budżetu (WFiB),
11) Wydział Geodezji i Nieruchomości (WGiN),
12) Wydział Organizacji i Rozwoju Zasobów Ludzkich (WOiRZL),
13) Wydział Administracyjny (WA),
14) Wydział Współpracy Międzynarodowej (WWM),
15) Biuro Koordynacyjne (BK),
16) Wydział Zarządzania RPO (WZRPO),
17) Wydział Wdrażania RPO (WWRPO),
18) Wydział Programów Rozwoju Obszarów Wiejskich (WPROW),
19) Regionalny Ośrodek Polityki Społecznej (ROPS),
20) Kancelaria Sejmiku (KS),
21) Biuro Radców Prawnych (BRP),
22) Biuro Ochrony Informacji Niejawnych (BOIN),
23) Biuro Spraw Obronnych i Bezpieczeństwa Publicznego (BSOiBP),
24) Biuro Audytu Wewnętrznego (BAW),
25) Biuro Kontroli Wewnętrznej (BKW),
26) Sekretariat Techniczny CETC (ST),
27) Centrum Obsługi Inwestorów i Eksporterów (COIE),
28) Wydział Zamiejscowy Urzędu (WZU).

Regulamin Organizacyjny Urzędu Marszałkowskiego Województwa Zachodniopomorskiego [1]